Gangguan struktur di antaranya adalah adanya batu ginjal, sumbatan ureter, pembesaran kelenjar prostat dan kelainan radiologi ginjal lainnya. Tingkat keparahan PGK yang makin tinggi akan membuat kondisi pasien semakin buruk dan mempersulit pengobatan.
Pasien dengan tingkat keparahan yang paling akhir dikatakan pasien jatuh pada kondisi penyakit ginjal kronik tahap akhir. Penyakit ginjal kronik tahap akhir adalah suatu kondisi dimana ginjal hanya mampu membersihkan darah kurang dari 10% fungsinya atau kurang dari 15 ml/menit.
Pada kondisi ini pasien sudah tidak bisa disembuhkan dengan obat-obatan dan diindikasikan mendapatkan terapi pengganti ginjal, yaitu cangkok ginjal, peritoneal dialisis atau hemodialisis regular.
Apabila terapi pengganti ginjal ini tidak dilakukan, pasien dapat mengalami lemah, mual, muntah, sesak nafas, batuk berdarah, kesadaran menurun, kejang, serangan jantung sampai dengan kematian.
